국방부는 26일 이상희 국방장관의 예산삭감 항의서한 파동과 관련, "이상희 장관이 기재부 장관에게 보내고 또 참고로 관련된 몇몇 분들에게 서신을 보낸 것은 예산이 확정되면 우리는 복종하고 시현하는 절차에 들어가게 되기 때문에 시행되기 전에, 대통령의 결심이 되기 전에 관계기관들이 올바르게 인식을 하고 판단하고 권유할 수 있도록 해야 한다는 내용이 주"라며 당위성을 강조했다.

원태제 국방부 대변인은 이날 오전 브리핑에서 이같이 말하며, 그러나 항명 사태로 비치는 데 대해선 "일부 보도에서 항의라든가 하극상, 반발, 돌출행동으로 비춰질 수 있다고 표현했는데 그것은 적절치 않은 표현이라고 본다. 서신내용 어디에도 그런 내용은 있지 않다"고 덧붙였다.

그는 그러나 장수만 차관의 청와대 예산축소 보고에 대해선 "개인적 차원에서 국방부 공식적인 의견은 아닌 것으로 본다"며 "(이상희 국방장관에게) 보고를 안 한 것"이라고 말해, 사실상 하극상 행위가 벌어졌음을 시사했다.

그는 장 차관 징계 여부에 대해선 "그 문제는 장관이 직접 유감 표명 내지는 질책한 것으로 알고 있다"며 즉답을 피한 뒤, "차관은 그런 문제로 인한 소문이 확산되지 않기를 바라고 있는 것으로 생각된다"고 밝혀 장 차관이 이번 파동에 크게 당황해하고 있음을 시사했다.